RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288422.3

TAB3-201, Transcript of TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene TAB3, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAB3-201ENST00000288422 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.9■■■■■ 6.86
TAB3-201ENST00000288422 ABCC9O60706 1549 aa52.54■■■■■ 6
TAB3-201ENST00000288422 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.2■■■■■ 5.95
TAB3-201ENST00000288422 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.84■■■■■ 5.57
TAB3-201ENST00000288422 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.79■■■■■ 5.56
TAB3-201ENST00000288422 NACADO15069 1562 aa49.41■■■■■ 5.5
TAB3-201ENST00000288422 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.76■■■■■ 5.4
TAB3-201ENST00000288422 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.75■■■■■ 5.39
TAB3-201ENST00000288422 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.69■■■■■ 5.39
TAB3-201ENST00000288422 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.67■■■■■ 5.38
TAB3-201ENST00000288422 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.56■■■■■ 5.36
TAB3-201ENST00000288422 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.26
TAB3-201ENST00000288422 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.87■■■■■ 5.25
TAB3-201ENST00000288422 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.84■■■■■ 5.25
TAB3-201ENST00000288422 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.5■■■■■ 5.19
TAB3-201ENST00000288422 SCRIBQ14160 1630 aa47.43■■■■■ 5.18
TAB3-201ENST00000288422 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.4■■■■■ 5.18
TAB3-201ENST00000288422 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.32■■■■■ 5.17
TAB3-201ENST00000288422 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46■■■■■ 4.95
TAB3-201ENST00000288422 NCAPD3P42695 1498 aa45.66■■■■■ 4.9
TAB3-201ENST00000288422 CUX2O14529 1486 aa45.55■■■■■ 4.88
TAB3-201ENST00000288422 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.44■■■■■ 4.87
TAB3-201ENST00000288422 ERCC6Q03468 1493 aa45.31■■■■■ 4.84
TAB3-201ENST00000288422 HMGXB3Q12766 1538 aa45.31■■■■■ 4.84
TAB3-201ENST00000288422 SMARCA4P51532 1647 aa45.27■■■■■ 4.84
TAB3-201ENST00000288422 SMARCA2P51531 1590 aa45.24■■■■■ 4.83
TAB3-201ENST00000288422 NESP48681 1621 aa45.05■■■■■ 4.8
TAB3-201ENST00000288422 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.94■■■■■ 4.79
TAB3-201ENST00000288422 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.93■■■■■ 4.78
TAB3-201ENST00000288422 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
TAB3-201ENST00000288422 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
TAB3-201ENST00000288422 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.68■■■■■ 4.74
TAB3-201ENST00000288422 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.61■■■■■ 4.73
TAB3-201ENST00000288422 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.45■■■■■ 4.71
TAB3-201ENST00000288422 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.35■■■■■ 4.69
TAB3-201ENST00000288422 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.18■■■■■ 4.66
TAB3-201ENST00000288422 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.06■■■■■ 4.64
TAB3-201ENST00000288422 WDR62O43379 1518 aa44.04■■■■■ 4.64
TAB3-201ENST00000288422 WIZO95785 1651 aa44■■■■■ 4.63
TAB3-201ENST00000288422 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.76■■■■■ 4.6
TAB3-201ENST00000288422 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.68■■■■■ 4.58
TAB3-201ENST00000288422 CFTRP13569 1480 aa43.64■■■■■ 4.58
TAB3-201ENST00000288422 TRIM41Q8WV44 630 aa43.6■■■■■ 4.57
TAB3-201ENST00000288422 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
TAB3-201ENST00000288422 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
TAB3-201ENST00000288422 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
TAB3-201ENST00000288422 OSCARQ8IYS5 282 aa43.21■■■■■ 4.51
TAB3-201ENST00000288422 PRDM2Q13029 1718 aa43.12■■■■■ 4.49
TAB3-201ENST00000288422 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.94■■■■■ 4.46
TAB3-201ENST00000288422 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
TAB3-201ENST00000288422 IFT140Q96RY7 1462 aa42.92■■■■■ 4.46
TAB3-201ENST00000288422 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.87■■■■■ 4.45
TAB3-201ENST00000288422 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.87■■■■■ 4.45
TAB3-201ENST00000288422 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.87■■■■■ 4.45
TAB3-201ENST00000288422 TOPBP1Q92547 1522 aa42.83■■■■■ 4.45
TAB3-201ENST00000288422 ARHGEF11O15085 1522 aa42.7■■■■■ 4.43
TAB3-201ENST00000288422 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.43
TAB3-201ENST00000288422 ABCC8Q09428 1581 aa42.64■■■■■ 4.42
TAB3-201ENST00000288422 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.64■■■■■ 4.42
TAB3-201ENST00000288422 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
TAB3-201ENST00000288422 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.43■■■■■ 4.38
TAB3-201ENST00000288422 CHD1O14646 1710 aa42.4■■■■■ 4.38
TAB3-201ENST00000288422 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
TAB3-201ENST00000288422 ARAP1Q96P48 1450 aa42.28■■■■■ 4.36
TAB3-201ENST00000288422 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.2■■■■■ 4.35
TAB3-201ENST00000288422 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.18■■■■■ 4.34
TAB3-201ENST00000288422 WDR97A6NE52 1622 aa42.07■■■■■ 4.33
TAB3-201ENST00000288422 SOGA1O94964 1423 aa42.07■■■■■ 4.33
TAB3-201ENST00000288422 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
TAB3-201ENST00000288422 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.03■■■■■ 4.32
TAB3-201ENST00000288422 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.01■■■■■ 4.32
TAB3-201ENST00000288422 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.01■■■■■ 4.32
TAB3-201ENST00000288422 FBLN2P98095 1184 aa42.01■■■■■ 4.32
TAB3-201ENST00000288422 CUX1P39880 1505 aa41.95■■■■■ 4.31
TAB3-201ENST00000288422 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
TAB3-201ENST00000288422 SYNJ1O43426 1573 aa41.82■■■■■ 4.29
TAB3-201ENST00000288422 GRIN2BQ13224 1484 aa41.81■■■■■ 4.28
TAB3-201ENST00000288422 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
TAB3-201ENST00000288422 SYNJ2O15056 1496 aa41.75■■■■■ 4.27
TAB3-201ENST00000288422 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
TAB3-201ENST00000288422 PBRM1Q86U86 1689 aa41.63■■■■■ 4.25
TAB3-201ENST00000288422 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.58■■■■■ 4.25
TAB3-201ENST00000288422 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.58■■■■■ 4.25
TAB3-201ENST00000288422 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.55■■■■■ 4.24
TAB3-201ENST00000288422 GRIN2AQ12879 1464 aa41.31■■■■■ 4.2
TAB3-201ENST00000288422 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.3■■■■■ 4.2
TAB3-201ENST00000288422 ADAMTS12P58397 1594 aa41.27■■■■■ 4.2
TAB3-201ENST00000288422 NUP160Q12769 1436 aa41.24■■■■■ 4.19
TAB3-201ENST00000288422 CEP170Q5SW79 1584 aa41.22■■■■■ 4.19
TAB3-201ENST00000288422 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.18
TAB3-201ENST00000288422 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.15■■■■■ 4.18
TAB3-201ENST00000288422 SHROOM2Q13796 1616 aa41.15■■■■■ 4.18
TAB3-201ENST00000288422 TOP2BQ02880 1626 aa41.13■■■■■ 4.17
TAB3-201ENST00000288422 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.05■■■■■ 4.16
TAB3-201ENST00000288422 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41■■■■■ 4.15
TAB3-201ENST00000288422 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
TAB3-201ENST00000288422 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
TAB3-201ENST00000288422 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.77■■■■■ 4.12
TAB3-201ENST00000288422 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.11
TAB3-201ENST00000288422 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.72■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms