Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms