Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms