Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIFKQ9BYG3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIFKQ9BYG3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIFKQ9BYG3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIFKQ9BYG3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIFKQ9BYG3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIFKQ9BYG3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIFKQ9BYG3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms