Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BBS2Q9BXC9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms