Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP8Q9BV40 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms