Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms