Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms