Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELF4Q99607 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms