Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PGLYRP3Q96LB9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PGLYRP3Q96LB9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PGLYRP3Q96LB9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PGLYRP3Q96LB9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PGLYRP3Q96LB9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PGLYRP3Q96LB9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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