Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKNOX2Q96KN3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms