Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
PRAC1Q96KF2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms