Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms