Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms