Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ZNF248Q8NDW4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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