Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms