Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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LRRC18Q8N456 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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