Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms