Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms