Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms