Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms