Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms