Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q6P435 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q6P435 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q6P435 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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