Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC4Q6P2E9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms