Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms