Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms