Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms