Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms