Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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