Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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CTF1Q16619 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CTF1Q16619 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CTF1Q16619 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CTF1Q16619 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CTF1Q16619 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CTF1Q16619 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CTF1Q16619 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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