Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF239Q16600 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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