Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BECN1Q14457 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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