Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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