Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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