Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGRF1Q13972 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms