Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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APOFQ13790 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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APOFQ13790 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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APOFQ13790 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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APOFQ13790 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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