Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCH1Q13635 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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