Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms