Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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