Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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