Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGDRQ13258 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms