Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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IFT88Q13099 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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IFT88Q13099 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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IFT88Q13099 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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