Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXM1Q08050 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms