Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms