Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK18Q07002 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms