Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms