Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms