Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNC1Q01954 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms