Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMF1P82094 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMF1P82094 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMF1P82094 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMF1P82094 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMF1P82094 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMF1P82094 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMF1P82094 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMF1P82094 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMF1P82094 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMF1P82094 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TMF1P82094 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMF1P82094 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMF1P82094 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms