Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB25P57735 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms